yourSIAL Epigenomic sequencing

Servizi disponibili:

yourSIAL Human MethylationEPIC: mediante questo servizio è possibile analizzare più di 850,000 siti di metilazione e quindi analizzare i polimorfismi a singolo nucleotide. Molteplici campioni, possono essere analizzati in parallelo, anche in FFPE, ed a partire da piccole quantità.

yourSIAL Metagenomic: il sequenziamento dell’RNA 16S è la principale applicazione del sequenziamento di ampliconi in metagenomica che permette di determinare le relazioni evolutive tra microrganismi, essendo una molecola relativamente grande, dotata della medesima funzione in ogni organismo, coinvolta nella sintesi delle proteine e per questo caratterizzata da regioni altamente conservate. Allo stesso tempo, le sequenze del gene 16S sono caratterizzare da regioni altamente variabili che presentano omologia solo tra batteri della stessa specie e che possono quindi essere sfruttate per analisi filogenetiche.

Il tipo di servizio offerto ha inizio con l’estrazione del DNA (facoltativa) a partire da diversi tipi di campioni come feci, suolo, acqua, filtri, pelle, tamponi vaginali ed endometrio; segue l’amplificazione con primer per le regioni variabili V3 e V4 del gene 16S rRNA per concludersi con il sequenziamento su piattaforma Illumina Miseq.
L’analisi bioinformatica di 1° livello è inclusa nel servizio, ovvero viene fornito un report di identificazione tassonomica (ordine – famiglia – genere – specie).